Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRIP1P50238 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms