Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GSK3BP49841 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GSK3BP49841 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms