Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPFP49454 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPFP49454 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPFP49454 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPFP49454 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPFP49454 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPFP49454 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPFP49454 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPFP49454 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPFP49454 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPFP49454 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPFP49454 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPFP49454 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPFP49454 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPFP49454 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPFP49454 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPFP49454 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPFP49454 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPFP49454 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPFP49454 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPFP49454 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPFP49454 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPFP49454 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPFP49454 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPFP49454 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPFP49454 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPFP49454 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPFP49454 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPFP49454 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPFP49454 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPFP49454 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPFP49454 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPFP49454 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CENPFP49454 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CENPFP49454 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPFP49454 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPFP49454 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPFP49454 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPFP49454 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPFP49454 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPFP49454 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPFP49454 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPFP49454 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPFP49454 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPFP49454 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPFP49454 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPFP49454 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPFP49454 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPFP49454 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPFP49454 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPFP49454 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPFP49454 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPFP49454 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPFP49454 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPFP49454 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPFP49454 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPFP49454 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPFP49454 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPFP49454 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPFP49454 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPFP49454 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPFP49454 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPFP49454 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPFP49454 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPFP49454 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPFP49454 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPFP49454 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPFP49454 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPFP49454 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPFP49454 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPFP49454 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPFP49454 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPFP49454 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPFP49454 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPFP49454 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPFP49454 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPFP49454 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPFP49454 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPFP49454 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPFP49454 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPFP49454 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPFP49454 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPFP49454 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPFP49454 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPFP49454 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPFP49454 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPFP49454 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPFP49454 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPFP49454 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPFP49454 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPFP49454 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPFP49454 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPFP49454 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPFP49454 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPFP49454 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPFP49454 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPFP49454 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPFP49454 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPFP49454 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPFP49454 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms