Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNI2P48788 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms