Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX1P48742 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX1P48742 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX1P48742 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX1P48742 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX1P48742 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX1P48742 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX1P48742 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX1P48742 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX1P48742 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX1P48742 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX1P48742 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX1P48742 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX1P48742 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX1P48742 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX1P48742 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX1P48742 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX1P48742 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX1P48742 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX1P48742 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX1P48742 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX1P48742 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX1P48742 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX1P48742 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX1P48742 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX1P48742 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX1P48742 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX1P48742 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX1P48742 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX1P48742 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX1P48742 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX1P48742 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX1P48742 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX1P48742 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX1P48742 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX1P48742 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX1P48742 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX1P48742 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX1P48742 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX1P48742 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX1P48742 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX1P48742 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX1P48742 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX1P48742 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX1P48742 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX1P48742 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX1P48742 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX1P48742 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX1P48742 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX1P48742 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX1P48742 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX1P48742 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX1P48742 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX1P48742 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX1P48742 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX1P48742 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX1P48742 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX1P48742 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX1P48742 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX1P48742 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX1P48742 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX1P48742 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX1P48742 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX1P48742 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX1P48742 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX1P48742 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX1P48742 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX1P48742 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX1P48742 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX1P48742 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX1P48742 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX1P48742 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX1P48742 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX1P48742 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX1P48742 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX1P48742 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX1P48742 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX1P48742 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX1P48742 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX1P48742 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX1P48742 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX1P48742 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX1P48742 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX1P48742 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX1P48742 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX1P48742 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX1P48742 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX1P48742 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX1P48742 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX1P48742 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX1P48742 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX1P48742 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX1P48742 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX1P48742 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX1P48742 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX1P48742 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX1P48742 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX1P48742 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX1P48742 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX1P48742 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms