Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMTP48728 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMTP48728 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMTP48728 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMTP48728 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMTP48728 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMTP48728 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMTP48728 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMTP48728 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMTP48728 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMTP48728 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMTP48728 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMTP48728 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMTP48728 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMTP48728 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMTP48728 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMTP48728 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMTP48728 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMTP48728 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMTP48728 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMTP48728 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMTP48728 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMTP48728 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMTP48728 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AMTP48728 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMTP48728 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMTP48728 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMTP48728 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMTP48728 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMTP48728 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMTP48728 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMTP48728 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMTP48728 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMTP48728 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMTP48728 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMTP48728 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMTP48728 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMTP48728 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMTP48728 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMTP48728 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMTP48728 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMTP48728 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMTP48728 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMTP48728 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMTP48728 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMTP48728 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMTP48728 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMTP48728 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMTP48728 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMTP48728 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMTP48728 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMTP48728 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AMTP48728 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMTP48728 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMTP48728 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMTP48728 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMTP48728 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMTP48728 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMTP48728 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMTP48728 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMTP48728 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMTP48728 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMTP48728 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMTP48728 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMTP48728 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMTP48728 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMTP48728 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMTP48728 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMTP48728 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AMTP48728 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMTP48728 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMTP48728 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMTP48728 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMTP48728 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMTP48728 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AMTP48728 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
AMTP48728 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMTP48728 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMTP48728 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMTP48728 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMTP48728 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMTP48728 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMTP48728 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMTP48728 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMTP48728 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMTP48728 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMTP48728 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMTP48728 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMTP48728 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AMTP48728 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMTP48728 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMTP48728 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMTP48728 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMTP48728 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMTP48728 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMTP48728 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMTP48728 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMTP48728 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMTP48728 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMTP48728 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms