Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMUP48645 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMUP48645 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMUP48645 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMUP48645 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMUP48645 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NMUP48645 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMUP48645 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMUP48645 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMUP48645 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMUP48645 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMUP48645 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMUP48645 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMUP48645 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMUP48645 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMUP48645 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMUP48645 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMUP48645 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMUP48645 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMUP48645 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMUP48645 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMUP48645 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMUP48645 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMUP48645 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMUP48645 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMUP48645 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMUP48645 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMUP48645 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMUP48645 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMUP48645 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMUP48645 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMUP48645 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMUP48645 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMUP48645 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMUP48645 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMUP48645 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMUP48645 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMUP48645 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMUP48645 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMUP48645 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMUP48645 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMUP48645 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMUP48645 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMUP48645 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMUP48645 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMUP48645 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMUP48645 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMUP48645 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMUP48645 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMUP48645 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMUP48645 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMUP48645 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMUP48645 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NMUP48645 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NMUP48645 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NMUP48645 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NMUP48645 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMUP48645 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMUP48645 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMUP48645 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMUP48645 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMUP48645 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMUP48645 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMUP48645 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMUP48645 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMUP48645 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMUP48645 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NMUP48645 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms