Protein–RNA interactions for Protein: P48147

PREP, Prolyl endopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREPP48147 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PREPP48147 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PREPP48147 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PREPP48147 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PREPP48147 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PREPP48147 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PREPP48147 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PREPP48147 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PREPP48147 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PREPP48147 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PREPP48147 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PREPP48147 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PREPP48147 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PREPP48147 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PREPP48147 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PREPP48147 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PREPP48147 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PREPP48147 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PREPP48147 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PREPP48147 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PREPP48147 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PREPP48147 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PREPP48147 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PREPP48147 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PREPP48147 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PREPP48147 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PREPP48147 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PREPP48147 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PREPP48147 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PREPP48147 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PREPP48147 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PREPP48147 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PREPP48147 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PREPP48147 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PREPP48147 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PREPP48147 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PREPP48147 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PREPP48147 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PREPP48147 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PREPP48147 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PREPP48147 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PREPP48147 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PREPP48147 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PREPP48147 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PREPP48147 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PREPP48147 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PREPP48147 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PREPP48147 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PREPP48147 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PREPP48147 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PREPP48147 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PREPP48147 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PREPP48147 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PREPP48147 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PREPP48147 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PREPP48147 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PREPP48147 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PREPP48147 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PREPP48147 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PREPP48147 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PREPP48147 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PREPP48147 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PREPP48147 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PREPP48147 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PREPP48147 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PREPP48147 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PREPP48147 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PREPP48147 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PREPP48147 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PREPP48147 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PREPP48147 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PREPP48147 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PREPP48147 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PREPP48147 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PREPP48147 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PREPP48147 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PREPP48147 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PREPP48147 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PREPP48147 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PREPP48147 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PREPP48147 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PREPP48147 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PREPP48147 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PREPP48147 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PREPP48147 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PREPP48147 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PREPP48147 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PREPP48147 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PREPP48147 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PREPP48147 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PREPP48147 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PREPP48147 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PREPP48147 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PREPP48147 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PREPP48147 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PREPP48147 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PREPP48147 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PREPP48147 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PREPP48147 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PREPP48147 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms