Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GNPDA1P46926 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNPDA1P46926 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms