Protein–RNA interactions for Protein: P46459

NSF, Vesicle-fusing ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFP46459 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSFP46459 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSFP46459 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSFP46459 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSFP46459 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSFP46459 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NSFP46459 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSFP46459 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSFP46459 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSFP46459 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NSFP46459 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSFP46459 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSFP46459 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NSFP46459 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSFP46459 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSFP46459 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSFP46459 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSFP46459 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NSFP46459 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSFP46459 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSFP46459 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSFP46459 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSFP46459 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSFP46459 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSFP46459 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSFP46459 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSFP46459 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSFP46459 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSFP46459 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSFP46459 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSFP46459 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSFP46459 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSFP46459 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSFP46459 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSFP46459 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSFP46459 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSFP46459 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSFP46459 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSFP46459 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSFP46459 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSFP46459 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSFP46459 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSFP46459 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSFP46459 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSFP46459 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSFP46459 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSFP46459 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSFP46459 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSFP46459 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSFP46459 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NSFP46459 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSFP46459 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSFP46459 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSFP46459 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSFP46459 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSFP46459 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSFP46459 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSFP46459 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSFP46459 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSFP46459 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NSFP46459 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSFP46459 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSFP46459 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSFP46459 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSFP46459 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSFP46459 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSFP46459 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSFP46459 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSFP46459 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSFP46459 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NSFP46459 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSFP46459 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSFP46459 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSFP46459 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSFP46459 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSFP46459 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSFP46459 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSFP46459 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSFP46459 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSFP46459 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSFP46459 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSFP46459 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSFP46459 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSFP46459 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSFP46459 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSFP46459 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSFP46459 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSFP46459 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSFP46459 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSFP46459 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSFP46459 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NSFP46459 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSFP46459 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFP46459 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFP46459 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFP46459 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFP46459 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFP46459 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFP46459 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSFP46459 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms