Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PIK3CAP42336 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIK3CAP42336 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIK3CAP42336 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.5 ms