Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGCXP38435 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGCXP38435 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGCXP38435 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGCXP38435 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGCXP38435 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGCXP38435 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGCXP38435 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGCXP38435 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGCXP38435 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGCXP38435 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGCXP38435 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGCXP38435 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGCXP38435 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGCXP38435 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGCXP38435 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GGCXP38435 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGCXP38435 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGCXP38435 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGCXP38435 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGCXP38435 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GGCXP38435 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGCXP38435 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGCXP38435 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGCXP38435 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGCXP38435 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGCXP38435 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGCXP38435 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGCXP38435 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGCXP38435 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGCXP38435 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGCXP38435 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGCXP38435 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGCXP38435 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGCXP38435 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGCXP38435 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGCXP38435 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGCXP38435 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGCXP38435 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGCXP38435 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGCXP38435 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGCXP38435 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GGCXP38435 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGCXP38435 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGCXP38435 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGCXP38435 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGCXP38435 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGCXP38435 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGCXP38435 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGCXP38435 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGCXP38435 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGCXP38435 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGCXP38435 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGCXP38435 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGCXP38435 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GGCXP38435 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGCXP38435 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGCXP38435 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGCXP38435 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGCXP38435 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGCXP38435 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGCXP38435 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGCXP38435 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGCXP38435 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGCXP38435 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGCXP38435 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGCXP38435 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGCXP38435 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGCXP38435 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGCXP38435 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGCXP38435 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGCXP38435 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGCXP38435 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GGCXP38435 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGCXP38435 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGCXP38435 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGCXP38435 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGCXP38435 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGCXP38435 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGCXP38435 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGCXP38435 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGCXP38435 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGCXP38435 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGCXP38435 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGCXP38435 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GGCXP38435 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGCXP38435 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGCXP38435 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GGCXP38435 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GGCXP38435 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGCXP38435 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGCXP38435 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGCXP38435 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGCXP38435 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GGCXP38435 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GGCXP38435 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GGCXP38435 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GGCXP38435 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GGCXP38435 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
GGCXP38435 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms