Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP62P37198 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP62P37198 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP62P37198 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP62P37198 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP62P37198 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP62P37198 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP62P37198 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP62P37198 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP62P37198 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP62P37198 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP62P37198 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP62P37198 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP62P37198 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP62P37198 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP62P37198 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP62P37198 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP62P37198 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP62P37198 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP62P37198 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP62P37198 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP62P37198 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP62P37198 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP62P37198 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP62P37198 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP62P37198 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP62P37198 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP62P37198 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP62P37198 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP62P37198 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP62P37198 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP62P37198 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP62P37198 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP62P37198 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP62P37198 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP62P37198 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP62P37198 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP62P37198 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP62P37198 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP62P37198 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP62P37198 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP62P37198 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP62P37198 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP62P37198 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP62P37198 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP62P37198 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP62P37198 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP62P37198 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP62P37198 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP62P37198 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP62P37198 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP62P37198 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP62P37198 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP62P37198 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP62P37198 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP62P37198 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP62P37198 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP62P37198 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP62P37198 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP62P37198 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP62P37198 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP62P37198 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NUP62P37198 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NUP62P37198 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NUP62P37198 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NUP62P37198 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NUP62P37198 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP62P37198 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP62P37198 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP62P37198 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP62P37198 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP62P37198 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP62P37198 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP62P37198 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP62P37198 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP62P37198 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP62P37198 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP62P37198 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP62P37198 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP62P37198 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP62P37198 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP62P37198 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP62P37198 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP62P37198 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP62P37198 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP62P37198 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP62P37198 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP62P37198 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP62P37198 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP62P37198 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP62P37198 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP62P37198 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP62P37198 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP62P37198 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP62P37198 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP62P37198 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP62P37198 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP62P37198 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP62P37198 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP62P37198 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms