Protein–RNA interactions for Protein: P36980

CFHR2, Complement factor H-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR2P36980 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFHR2P36980 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFHR2P36980 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms