Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5C1P36542 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5C1P36542 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms