Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXD12P35452 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD12P35452 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms