Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CXCR5P32302 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR5P32302 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms