Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
APOBEC3AP31941 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms