Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXC12P31275 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms