Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA6P31267 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA6P31267 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA6P31267 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA6P31267 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA6P31267 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA6P31267 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA6P31267 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA6P31267 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA6P31267 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA6P31267 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA6P31267 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA6P31267 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA6P31267 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA6P31267 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA6P31267 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA6P31267 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA6P31267 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA6P31267 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA6P31267 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA6P31267 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA6P31267 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA6P31267 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA6P31267 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXA6P31267 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms