Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CLIP1P30622 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
CLIP1P30622 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms