Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TM4SF1P30408 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TM4SF1P30408 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms