Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHS1P30084 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms