Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP1P28562 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms