Protein–RNA interactions for Protein: P28476

GABRR2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR2P28476 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRR2P28476 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRR2P28476 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRR2P28476 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRR2P28476 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRR2P28476 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRR2P28476 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRR2P28476 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRR2P28476 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRR2P28476 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRR2P28476 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRR2P28476 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRR2P28476 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRR2P28476 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRR2P28476 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRR2P28476 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRR2P28476 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRR2P28476 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRR2P28476 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms