Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLD1P28340 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLD1P28340 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLD1P28340 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
POLD1P28340 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
POLD1P28340 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
POLD1P28340 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLD1P28340 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLD1P28340 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLD1P28340 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLD1P28340 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLD1P28340 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLD1P28340 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLD1P28340 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLD1P28340 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLD1P28340 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLD1P28340 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLD1P28340 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLD1P28340 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLD1P28340 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLD1P28340 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLD1P28340 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLD1P28340 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLD1P28340 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLD1P28340 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLD1P28340 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLD1P28340 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLD1P28340 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLD1P28340 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLD1P28340 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLD1P28340 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLD1P28340 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLD1P28340 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLD1P28340 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
POLD1P28340 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
POLD1P28340 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLD1P28340 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
POLD1P28340 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLD1P28340 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLD1P28340 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLD1P28340 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLD1P28340 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLD1P28340 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLD1P28340 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLD1P28340 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLD1P28340 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLD1P28340 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
POLD1P28340 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLD1P28340 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
POLD1P28340 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLD1P28340 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLD1P28340 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLD1P28340 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLD1P28340 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLD1P28340 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLD1P28340 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLD1P28340 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLD1P28340 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLD1P28340 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLD1P28340 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLD1P28340 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLD1P28340 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLD1P28340 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLD1P28340 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLD1P28340 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLD1P28340 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLD1P28340 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLD1P28340 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLD1P28340 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLD1P28340 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLD1P28340 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLD1P28340 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLD1P28340 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLD1P28340 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLD1P28340 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLD1P28340 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLD1P28340 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLD1P28340 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLD1P28340 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLD1P28340 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLD1P28340 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLD1P28340 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLD1P28340 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLD1P28340 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLD1P28340 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLD1P28340 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLD1P28340 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLD1P28340 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLD1P28340 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLD1P28340 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLD1P28340 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLD1P28340 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLD1P28340 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLD1P28340 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLD1P28340 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLD1P28340 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLD1P28340 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLD1P28340 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLD1P28340 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLD1P28340 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms