Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA1P25391 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA1P25391 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA1P25391 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA1P25391 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LAMA1P25391 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA1P25391 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA1P25391 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA1P25391 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA1P25391 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA1P25391 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA1P25391 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA1P25391 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LAMA1P25391 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA1P25391 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA1P25391 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA1P25391 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA1P25391 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA1P25391 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA1P25391 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA1P25391 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA1P25391 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LAMA1P25391 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA1P25391 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA1P25391 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LAMA1P25391 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA1P25391 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA1P25391 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA1P25391 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA1P25391 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA1P25391 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA1P25391 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA1P25391 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA1P25391 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA1P25391 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA1P25391 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA1P25391 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA1P25391 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA1P25391 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA1P25391 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA1P25391 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA1P25391 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA1P25391 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA1P25391 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA1P25391 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA1P25391 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAMA1P25391 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms