Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR2AP24928 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2AP24928 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms