Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNE1P24864 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNE1P24864 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNE1P24864 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms