Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP5F1P24539 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms