Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNFSF4P23510 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFSF4P23510 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms