Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALB2P22676 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALB2P22676 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALB2P22676 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALB2P22676 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALB2P22676 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALB2P22676 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALB2P22676 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALB2P22676 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALB2P22676 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALB2P22676 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALB2P22676 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALB2P22676 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CALB2P22676 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALB2P22676 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALB2P22676 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALB2P22676 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALB2P22676 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALB2P22676 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALB2P22676 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALB2P22676 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALB2P22676 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALB2P22676 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALB2P22676 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALB2P22676 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CALB2P22676 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALB2P22676 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALB2P22676 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALB2P22676 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALB2P22676 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALB2P22676 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALB2P22676 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CALB2P22676 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALB2P22676 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALB2P22676 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALB2P22676 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALB2P22676 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALB2P22676 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALB2P22676 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALB2P22676 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CALB2P22676 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CALB2P22676 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALB2P22676 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CALB2P22676 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CALB2P22676 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CALB2P22676 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CALB2P22676 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALB2P22676 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALB2P22676 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALB2P22676 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALB2P22676 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALB2P22676 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALB2P22676 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALB2P22676 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALB2P22676 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALB2P22676 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALB2P22676 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALB2P22676 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CALB2P22676 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALB2P22676 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALB2P22676 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALB2P22676 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALB2P22676 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALB2P22676 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALB2P22676 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALB2P22676 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALB2P22676 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CALB2P22676 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALB2P22676 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALB2P22676 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALB2P22676 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALB2P22676 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALB2P22676 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALB2P22676 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALB2P22676 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALB2P22676 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALB2P22676 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALB2P22676 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CALB2P22676 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALB2P22676 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALB2P22676 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALB2P22676 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALB2P22676 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALB2P22676 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALB2P22676 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALB2P22676 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALB2P22676 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALB2P22676 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALB2P22676 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALB2P22676 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALB2P22676 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALB2P22676 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALB2P22676 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALB2P22676 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALB2P22676 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALB2P22676 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CALB2P22676 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALB2P22676 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALB2P22676 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CALB2P22676 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms