Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX1P22670 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX1P22670 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX1P22670 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX1P22670 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX1P22670 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX1P22670 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX1P22670 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX1P22670 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX1P22670 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX1P22670 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX1P22670 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX1P22670 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX1P22670 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX1P22670 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX1P22670 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX1P22670 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX1P22670 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX1P22670 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX1P22670 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX1P22670 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX1P22670 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX1P22670 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX1P22670 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX1P22670 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX1P22670 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX1P22670 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX1P22670 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX1P22670 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX1P22670 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX1P22670 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX1P22670 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX1P22670 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX1P22670 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX1P22670 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX1P22670 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX1P22670 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX1P22670 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX1P22670 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX1P22670 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX1P22670 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX1P22670 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX1P22670 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX1P22670 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX1P22670 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX1P22670 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX1P22670 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX1P22670 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX1P22670 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX1P22670 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX1P22670 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX1P22670 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX1P22670 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX1P22670 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX1P22670 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX1P22670 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX1P22670 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX1P22670 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX1P22670 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX1P22670 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX1P22670 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX1P22670 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX1P22670 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX1P22670 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX1P22670 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX1P22670 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX1P22670 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX1P22670 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX1P22670 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX1P22670 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX1P22670 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX1P22670 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX1P22670 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFX1P22670 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFX1P22670 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFX1P22670 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFX1P22670 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFX1P22670 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFX1P22670 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFX1P22670 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFX1P22670 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RFX1P22670 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFX1P22670 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RFX1P22670 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFX1P22670 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFX1P22670 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFX1P22670 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFX1P22670 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFX1P22670 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFX1P22670 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX1P22670 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX1P22670 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX1P22670 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX1P22670 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX1P22670 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX1P22670 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX1P22670 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX1P22670 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX1P22670 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX1P22670 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms