Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C4BPBP20851 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms