Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASTP20810 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASTP20810 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASTP20810 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASTP20810 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASTP20810 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASTP20810 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASTP20810 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASTP20810 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASTP20810 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASTP20810 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASTP20810 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASTP20810 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASTP20810 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASTP20810 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASTP20810 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASTP20810 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASTP20810 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASTP20810 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASTP20810 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASTP20810 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CASTP20810 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASTP20810 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASTP20810 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CASTP20810 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASTP20810 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASTP20810 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASTP20810 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASTP20810 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASTP20810 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASTP20810 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASTP20810 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASTP20810 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASTP20810 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CASTP20810 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASTP20810 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASTP20810 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASTP20810 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASTP20810 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASTP20810 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASTP20810 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASTP20810 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASTP20810 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASTP20810 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASTP20810 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASTP20810 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASTP20810 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASTP20810 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASTP20810 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASTP20810 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASTP20810 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASTP20810 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASTP20810 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASTP20810 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASTP20810 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASTP20810 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASTP20810 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASTP20810 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CASTP20810 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASTP20810 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASTP20810 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CASTP20810 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASTP20810 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASTP20810 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASTP20810 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASTP20810 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASTP20810 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CASTP20810 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASTP20810 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASTP20810 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASTP20810 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASTP20810 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASTP20810 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASTP20810 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASTP20810 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CASTP20810 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CASTP20810 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASTP20810 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASTP20810 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CASTP20810 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASTP20810 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASTP20810 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASTP20810 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASTP20810 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASTP20810 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASTP20810 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASTP20810 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASTP20810 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASTP20810 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASTP20810 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASTP20810 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASTP20810 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASTP20810 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASTP20810 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASTP20810 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASTP20810 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASTP20810 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASTP20810 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASTP20810 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CASTP20810 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms