Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NR1D1P20393 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR1D1P20393 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms