Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A1P19634 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms