Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATF3P18847 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATF3P18847 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATF3P18847 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATF3P18847 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATF3P18847 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATF3P18847 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATF3P18847 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATF3P18847 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATF3P18847 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATF3P18847 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATF3P18847 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATF3P18847 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATF3P18847 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATF3P18847 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATF3P18847 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATF3P18847 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATF3P18847 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATF3P18847 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATF3P18847 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATF3P18847 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATF3P18847 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATF3P18847 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATF3P18847 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATF3P18847 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATF3P18847 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATF3P18847 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATF3P18847 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATF3P18847 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATF3P18847 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ATF3P18847 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATF3P18847 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
ATF3P18847 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATF3P18847 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ATF3P18847 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATF3P18847 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATF3P18847 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATF3P18847 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATF3P18847 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATF3P18847 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATF3P18847 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATF3P18847 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATF3P18847 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATF3P18847 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATF3P18847 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATF3P18847 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATF3P18847 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATF3P18847 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATF3P18847 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATF3P18847 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATF3P18847 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATF3P18847 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATF3P18847 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATF3P18847 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATF3P18847 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATF3P18847 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATF3P18847 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ATF3P18847 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATF3P18847 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATF3P18847 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATF3P18847 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATF3P18847 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATF3P18847 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATF3P18847 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATF3P18847 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATF3P18847 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ATF3P18847 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATF3P18847 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATF3P18847 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATF3P18847 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATF3P18847 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATF3P18847 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATF3P18847 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATF3P18847 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATF3P18847 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATF3P18847 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATF3P18847 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATF3P18847 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATF3P18847 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATF3P18847 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ATF3P18847 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ATF3P18847 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATF3P18847 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATF3P18847 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATF3P18847 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATF3P18847 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATF3P18847 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATF3P18847 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATF3P18847 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATF3P18847 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATF3P18847 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATF3P18847 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATF3P18847 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATF3P18847 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATF3P18847 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATF3P18847 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATF3P18847 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATF3P18847 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ATF3P18847 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATF3P18847 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms