Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPN1P18031 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms