Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GM2AP17900 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GM2AP17900 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GM2AP17900 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GM2AP17900 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GM2AP17900 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GM2AP17900 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GM2AP17900 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GM2AP17900 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GM2AP17900 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GM2AP17900 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GM2AP17900 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GM2AP17900 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GM2AP17900 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GM2AP17900 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GM2AP17900 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GM2AP17900 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GM2AP17900 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GM2AP17900 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GM2AP17900 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GM2AP17900 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GM2AP17900 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GM2AP17900 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GM2AP17900 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GM2AP17900 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GM2AP17900 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GM2AP17900 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GM2AP17900 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GM2AP17900 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GM2AP17900 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GM2AP17900 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GM2AP17900 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GM2AP17900 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GM2AP17900 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GM2AP17900 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GM2AP17900 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GM2AP17900 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GM2AP17900 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GM2AP17900 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GM2AP17900 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GM2AP17900 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GM2AP17900 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GM2AP17900 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GM2AP17900 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GM2AP17900 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GM2AP17900 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GM2AP17900 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GM2AP17900 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GM2AP17900 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GM2AP17900 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GM2AP17900 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GM2AP17900 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GM2AP17900 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GM2AP17900 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GM2AP17900 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GM2AP17900 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GM2AP17900 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GM2AP17900 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GM2AP17900 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GM2AP17900 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GM2AP17900 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GM2AP17900 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GM2AP17900 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GM2AP17900 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GM2AP17900 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GM2AP17900 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GM2AP17900 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GM2AP17900 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GM2AP17900 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GM2AP17900 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GM2AP17900 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GM2AP17900 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GM2AP17900 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GM2AP17900 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GM2AP17900 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GM2AP17900 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GM2AP17900 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GM2AP17900 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GM2AP17900 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GM2AP17900 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GM2AP17900 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GM2AP17900 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GM2AP17900 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GM2AP17900 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GM2AP17900 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GM2AP17900 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GM2AP17900 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GM2AP17900 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GM2AP17900 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GM2AP17900 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GM2AP17900 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GM2AP17900 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GM2AP17900 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GM2AP17900 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GM2AP17900 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GM2AP17900 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GM2AP17900 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GM2AP17900 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GM2AP17900 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GM2AP17900 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms