Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB3P16520 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB3P16520 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB3P16520 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB3P16520 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB3P16520 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB3P16520 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB3P16520 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB3P16520 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB3P16520 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB3P16520 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB3P16520 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB3P16520 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GNB3P16520 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB3P16520 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB3P16520 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB3P16520 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB3P16520 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB3P16520 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB3P16520 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB3P16520 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB3P16520 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB3P16520 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB3P16520 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB3P16520 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB3P16520 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB3P16520 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB3P16520 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB3P16520 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB3P16520 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB3P16520 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB3P16520 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB3P16520 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB3P16520 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GNB3P16520 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB3P16520 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB3P16520 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB3P16520 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB3P16520 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB3P16520 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB3P16520 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB3P16520 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB3P16520 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GNB3P16520 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB3P16520 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB3P16520 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB3P16520 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB3P16520 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB3P16520 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB3P16520 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB3P16520 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB3P16520 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB3P16520 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB3P16520 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB3P16520 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB3P16520 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB3P16520 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB3P16520 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB3P16520 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB3P16520 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB3P16520 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB3P16520 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GNB3P16520 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GNB3P16520 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GNB3P16520 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GNB3P16520 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GNB3P16520 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GNB3P16520 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GNB3P16520 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GNB3P16520 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GNB3P16520 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GNB3P16520 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNB3P16520 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNB3P16520 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNB3P16520 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNB3P16520 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNB3P16520 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GNB3P16520 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB3P16520 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB3P16520 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB3P16520 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB3P16520 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB3P16520 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB3P16520 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB3P16520 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB3P16520 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB3P16520 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB3P16520 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB3P16520 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB3P16520 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB3P16520 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB3P16520 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB3P16520 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GNB3P16520 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB3P16520 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB3P16520 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB3P16520 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB3P16520 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB3P16520 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GNB3P16520 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms