Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ITGB4P16144 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms