Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT10P13645 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT10P13645 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT10P13645 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT10P13645 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT10P13645 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT10P13645 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT10P13645 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT10P13645 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT10P13645 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT10P13645 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT10P13645 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT10P13645 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT10P13645 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT10P13645 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT10P13645 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT10P13645 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT10P13645 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT10P13645 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT10P13645 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT10P13645 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT10P13645 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT10P13645 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT10P13645 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT10P13645 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT10P13645 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT10P13645 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT10P13645 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT10P13645 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT10P13645 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT10P13645 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT10P13645 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT10P13645 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT10P13645 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT10P13645 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT10P13645 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT10P13645 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT10P13645 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT10P13645 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT10P13645 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT10P13645 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT10P13645 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT10P13645 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT10P13645 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT10P13645 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT10P13645 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT10P13645 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT10P13645 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT10P13645 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT10P13645 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT10P13645 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT10P13645 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT10P13645 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT10P13645 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT10P13645 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT10P13645 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT10P13645 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT10P13645 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT10P13645 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT10P13645 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT10P13645 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT10P13645 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT10P13645 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT10P13645 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT10P13645 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT10P13645 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT10P13645 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT10P13645 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT10P13645 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT10P13645 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT10P13645 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT10P13645 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT10P13645 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT10P13645 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT10P13645 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT10P13645 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT10P13645 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT10P13645 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT10P13645 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT10P13645 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT10P13645 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT10P13645 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT10P13645 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT10P13645 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT10P13645 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT10P13645 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT10P13645 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT10P13645 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT10P13645 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT10P13645 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT10P13645 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT10P13645 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT10P13645 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT10P13645 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT10P13645 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT10P13645 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT10P13645 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT10P13645 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT10P13645 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT10P13645 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms