Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CFTRP13569 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
CFTRP13569 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CFTRP13569 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CFTRP13569 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CFTRP13569 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CFTRP13569 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CFTRP13569 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CFTRP13569 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CFTRP13569 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CFTRP13569 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CFTRP13569 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CFTRP13569 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CFTRP13569 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CFTRP13569 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CFTRP13569 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CFTRP13569 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CFTRP13569 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CFTRP13569 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CFTRP13569 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CFTRP13569 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CFTRP13569 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CFTRP13569 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CFTRP13569 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
CFTRP13569 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CFTRP13569 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CFTRP13569 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CFTRP13569 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CFTRP13569 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CFTRP13569 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CFTRP13569 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CFTRP13569 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CFTRP13569 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CFTRP13569 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CFTRP13569 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CFTRP13569 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CFTRP13569 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CFTRP13569 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CFTRP13569 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CFTRP13569 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CFTRP13569 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
CFTRP13569 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
CFTRP13569 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
CFTRP13569 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CFTRP13569 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CFTRP13569 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CFTRP13569 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CFTRP13569 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CFTRP13569 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CFTRP13569 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CFTRP13569 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
CFTRP13569 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
CFTRP13569 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CFTRP13569 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CFTRP13569 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CFTRP13569 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CFTRP13569 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CFTRP13569 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CFTRP13569 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CFTRP13569 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CFTRP13569 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CFTRP13569 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CFTRP13569 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CFTRP13569 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CFTRP13569 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CFTRP13569 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CFTRP13569 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CFTRP13569 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CFTRP13569 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CFTRP13569 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CFTRP13569 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CFTRP13569 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CFTRP13569 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CFTRP13569 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CFTRP13569 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CFTRP13569 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CFTRP13569 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CFTRP13569 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CFTRP13569 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CFTRP13569 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CFTRP13569 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CFTRP13569 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
CFTRP13569 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CFTRP13569 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
CFTRP13569 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CFTRP13569 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CFTRP13569 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CFTRP13569 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CFTRP13569 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CFTRP13569 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CFTRP13569 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CFTRP13569 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CFTRP13569 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CFTRP13569 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CFTRP13569 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CFTRP13569 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CFTRP13569 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CFTRP13569 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CFTRP13569 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CFTRP13569 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms