Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL5P13501 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL5P13501 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL5P13501 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL5P13501 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL5P13501 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL5P13501 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL5P13501 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCL5P13501 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL5P13501 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL5P13501 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL5P13501 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL5P13501 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL5P13501 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL5P13501 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL5P13501 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL5P13501 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL5P13501 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCL5P13501 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL5P13501 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL5P13501 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL5P13501 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL5P13501 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL5P13501 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL5P13501 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL5P13501 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL5P13501 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL5P13501 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCL5P13501 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL5P13501 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL5P13501 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL5P13501 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL5P13501 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL5P13501 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL5P13501 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL5P13501 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL5P13501 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL5P13501 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL5P13501 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL5P13501 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL5P13501 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL5P13501 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL5P13501 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL5P13501 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL5P13501 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCL5P13501 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL5P13501 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL5P13501 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL5P13501 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL5P13501 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL5P13501 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL5P13501 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL5P13501 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL5P13501 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL5P13501 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCL5P13501 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCL5P13501 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCL5P13501 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL5P13501 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL5P13501 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL5P13501 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL5P13501 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL5P13501 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL5P13501 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL5P13501 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCL5P13501 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL5P13501 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL5P13501 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL5P13501 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL5P13501 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL5P13501 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCL5P13501 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL5P13501 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL5P13501 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL5P13501 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL5P13501 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL5P13501 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL5P13501 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL5P13501 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL5P13501 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL5P13501 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL5P13501 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL5P13501 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL5P13501 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL5P13501 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCL5P13501 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL5P13501 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL5P13501 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL5P13501 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL5P13501 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL5P13501 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL5P13501 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL5P13501 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL5P13501 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL5P13501 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL5P13501 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL5P13501 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL5P13501 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL5P13501 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCL5P13501 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms