Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL4P12829 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYL4P12829 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL4P12829 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL4P12829 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL4P12829 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL4P12829 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL4P12829 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL4P12829 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL4P12829 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL4P12829 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL4P12829 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL4P12829 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL4P12829 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYL4P12829 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYL4P12829 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYL4P12829 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYL4P12829 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYL4P12829 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYL4P12829 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYL4P12829 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MYL4P12829 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MYL4P12829 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYL4P12829 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MYL4P12829 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYL4P12829 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYL4P12829 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYL4P12829 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYL4P12829 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYL4P12829 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYL4P12829 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYL4P12829 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYL4P12829 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYL4P12829 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYL4P12829 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYL4P12829 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYL4P12829 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MYL4P12829 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYL4P12829 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYL4P12829 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYL4P12829 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYL4P12829 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYL4P12829 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYL4P12829 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYL4P12829 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYL4P12829 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYL4P12829 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYL4P12829 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYL4P12829 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYL4P12829 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYL4P12829 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYL4P12829 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MYL4P12829 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYL4P12829 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYL4P12829 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYL4P12829 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYL4P12829 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYL4P12829 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYL4P12829 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYL4P12829 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYL4P12829 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYL4P12829 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYL4P12829 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYL4P12829 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MYL4P12829 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYL4P12829 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYL4P12829 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYL4P12829 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYL4P12829 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYL4P12829 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYL4P12829 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYL4P12829 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYL4P12829 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYL4P12829 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYL4P12829 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYL4P12829 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYL4P12829 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MYL4P12829 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYL4P12829 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYL4P12829 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYL4P12829 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYL4P12829 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYL4P12829 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYL4P12829 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYL4P12829 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYL4P12829 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYL4P12829 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYL4P12829 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYL4P12829 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MYL4P12829 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYL4P12829 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYL4P12829 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYL4P12829 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYL4P12829 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYL4P12829 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYL4P12829 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYL4P12829 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYL4P12829 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYL4P12829 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYL4P12829 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms