Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKBP12277 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKBP12277 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKBP12277 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKBP12277 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKBP12277 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKBP12277 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKBP12277 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKBP12277 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKBP12277 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKBP12277 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKBP12277 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKBP12277 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKBP12277 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CKBP12277 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKBP12277 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CKBP12277 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKBP12277 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKBP12277 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKBP12277 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKBP12277 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKBP12277 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKBP12277 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CKBP12277 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CKBP12277 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CKBP12277 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CKBP12277 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CKBP12277 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CKBP12277 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CKBP12277 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKBP12277 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKBP12277 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKBP12277 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKBP12277 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CKBP12277 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKBP12277 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CKBP12277 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKBP12277 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKBP12277 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKBP12277 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CKBP12277 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CKBP12277 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKBP12277 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKBP12277 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKBP12277 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKBP12277 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKBP12277 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKBP12277 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKBP12277 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKBP12277 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKBP12277 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKBP12277 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKBP12277 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKBP12277 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKBP12277 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKBP12277 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKBP12277 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKBP12277 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKBP12277 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKBP12277 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CKBP12277 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKBP12277 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKBP12277 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKBP12277 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKBP12277 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKBP12277 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKBP12277 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKBP12277 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKBP12277 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKBP12277 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKBP12277 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKBP12277 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CKBP12277 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CKBP12277 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKBP12277 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKBP12277 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKBP12277 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CKBP12277 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CKBP12277 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CKBP12277 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CKBP12277 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CKBP12277 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CKBP12277 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CKBP12277 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CKBP12277 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CKBP12277 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CKBP12277 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CKBP12277 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CKBP12277 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CKBP12277 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CKBP12277 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CKBP12277 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CKBP12277 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CKBP12277 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKBP12277 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKBP12277 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKBP12277 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKBP12277 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKBP12277 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CKBP12277 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1274.9 ms