Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ODC1P11926 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODC1P11926 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODC1P11926 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODC1P11926 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ODC1P11926 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODC1P11926 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODC1P11926 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODC1P11926 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODC1P11926 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODC1P11926 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODC1P11926 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ODC1P11926 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODC1P11926 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODC1P11926 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODC1P11926 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ODC1P11926 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODC1P11926 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODC1P11926 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODC1P11926 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ODC1P11926 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ODC1P11926 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODC1P11926 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODC1P11926 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODC1P11926 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ODC1P11926 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODC1P11926 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODC1P11926 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODC1P11926 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODC1P11926 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODC1P11926 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODC1P11926 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODC1P11926 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ODC1P11926 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODC1P11926 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODC1P11926 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODC1P11926 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODC1P11926 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODC1P11926 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODC1P11926 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODC1P11926 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODC1P11926 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODC1P11926 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODC1P11926 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODC1P11926 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODC1P11926 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODC1P11926 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODC1P11926 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODC1P11926 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODC1P11926 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ODC1P11926 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ODC1P11926 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ODC1P11926 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ODC1P11926 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ODC1P11926 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ODC1P11926 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ODC1P11926 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ODC1P11926 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ODC1P11926 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ODC1P11926 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ODC1P11926 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODC1P11926 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODC1P11926 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODC1P11926 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODC1P11926 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ODC1P11926 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODC1P11926 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODC1P11926 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODC1P11926 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ODC1P11926 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODC1P11926 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODC1P11926 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODC1P11926 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODC1P11926 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODC1P11926 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ODC1P11926 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODC1P11926 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODC1P11926 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ODC1P11926 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ODC1P11926 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ODC1P11926 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ODC1P11926 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ODC1P11926 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ODC1P11926 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ODC1P11926 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ODC1P11926 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ODC1P11926 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ODC1P11926 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ODC1P11926 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODC1P11926 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODC1P11926 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODC1P11926 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODC1P11926 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODC1P11926 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODC1P11926 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODC1P11926 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODC1P11926 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODC1P11926 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ODC1P11926 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODC1P11926 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms