Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GLI2P10070 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GLI2P10070 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GLI2P10070 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GLI2P10070 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GLI2P10070 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GLI2P10070 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GLI2P10070 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
GLI2P10070 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GLI2P10070 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GLI2P10070 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GLI2P10070 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GLI2P10070 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GLI2P10070 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GLI2P10070 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GLI2P10070 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GLI2P10070 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GLI2P10070 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
GLI2P10070 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
GLI2P10070 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
GLI2P10070 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GLI2P10070 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
GLI2P10070 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
GLI2P10070 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
GLI2P10070 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
GLI2P10070 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GLI2P10070 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GLI2P10070 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GLI2P10070 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GLI2P10070 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GLI2P10070 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GLI2P10070 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GLI2P10070 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GLI2P10070 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GLI2P10070 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GLI2P10070 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GLI2P10070 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GLI2P10070 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GLI2P10070 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GLI2P10070 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GLI2P10070 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GLI2P10070 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GLI2P10070 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
GLI2P10070 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GLI2P10070 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GLI2P10070 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GLI2P10070 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
GLI2P10070 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GLI2P10070 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GLI2P10070 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GLI2P10070 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GLI2P10070 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GLI2P10070 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GLI2P10070 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GLI2P10070 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GLI2P10070 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
GLI2P10070 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GLI2P10070 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GLI2P10070 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GLI2P10070 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
GLI2P10070 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
GLI2P10070 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
GLI2P10070 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GLI2P10070 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GLI2P10070 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GLI2P10070 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GLI2P10070 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
GLI2P10070 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GLI2P10070 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GLI2P10070 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GLI2P10070 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GLI2P10070 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GLI2P10070 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
GLI2P10070 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GLI2P10070 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GLI2P10070 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GLI2P10070 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
GLI2P10070 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GLI2P10070 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GLI2P10070 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GLI2P10070 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GLI2P10070 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GLI2P10070 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GLI2P10070 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GLI2P10070 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GLI2P10070 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GLI2P10070 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GLI2P10070 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GLI2P10070 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GLI2P10070 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GLI2P10070 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
GLI2P10070 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GLI2P10070 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GLI2P10070 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GLI2P10070 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GLI2P10070 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GLI2P10070 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GLI2P10070 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GLI2P10070 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
GLI2P10070 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms