Protein–RNA interactions for Protein: P0DMU3

FAM231A/C-like protein LOC102723383, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0DMU3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0DMU3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0DMU3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0DMU3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0DMU3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0DMU3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0DMU3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0DMU3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0DMU3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0DMU3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0DMU3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0DMU3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0DMU3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0DMU3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P0DMU3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0DMU3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0DMU3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P0DMU3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0DMU3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P0DMU3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0DMU3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0DMU3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0DMU3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0DMU3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0DMU3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P0DMU3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P0DMU3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0DMU3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0DMU3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0DMU3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0DMU3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0DMU3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0DMU3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0DMU3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P0DMU3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0DMU3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0DMU3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0DMU3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P0DMU3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0DMU3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0DMU3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0DMU3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0DMU3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0DMU3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0DMU3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0DMU3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P0DMU3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0DMU3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0DMU3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0DMU3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0DMU3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0DMU3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0DMU3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0DMU3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0DMU3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0DMU3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0DMU3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0DMU3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0DMU3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P0DMU3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0DMU3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0DMU3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0DMU3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0DMU3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0DMU3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0DMU3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0DMU3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0DMU3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0DMU3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0DMU3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0DMU3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0DMU3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P0DMU3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P0DMU3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms